O Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas (INI/Fiocruz) integra redes internacionais voltadas ao desenvolvimento de estudos clínicos sobre o tratamento e a prevenção da infecção pelo HIV, compreendendo:

• Aids Clinical Trials Group (ACTG/NIAID/NIH);
• HIV Prevention Trials Network (HPTN/NIAID/NIH)

A instituição mantém projetos de pesquisa em cooperação técnica com a Agência Francesa de Pesquisas sobre o HIV/Aids e Hepatites Virais (ANRS) e com o Instituto Nacional de Saúde Infantil e Desenvolvimento Humano (NICHD), vinculado ao governo canadense.

No âmbito do ensino, a Coordenação Stricto Sensu desenvolve atividades de cooperação acadêmica com instituições estrangeiras, abrangendo a realização de seminários, conferências técnicas e atividades letivas conjuntas com a participação de docentes e pesquisadores vinculados a órgãos internacionais, como a Universidade de Lille (França), a Universidade McGill (Canadá), a Universidade de Illinois (EUA) e o Centers for Disease Control and Prevention (CDC/EUA).